|
MicroRNA and Target Gene Description: |
|||
miRNA Name | mmu-miR-539-3p | miRNA Sequence | CAUACAAGGAUAAUUUCUUUUU |
Target Score | 51 | Seed Location | 352, 4717 |
NCBI Gene ID | 11991 | GenBank Accession | NM_001077266 |
Gene Symbol | Hnrnpd | 3' UTR Length | 5429 |
Gene Description | heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D | ||
3' UTR Sequence |
|||
1 attattccat ttgcaactta tccccaacag gtggtgaagc agtattttcc aatttgaaga 61 ttcatttgaa ggtggctcct gccacctgct aatagcagtt caaactaaat tttttctatc 121 aagttcctga atggaagtat gacgttgggt ccctctgaag tttaattctg agttctcatt 181 aaaagaattt gctttcattg ttttatttct taattgctat gcttcagtat caatttgtgt 241 tttatgcccc ccctcccccc cagtattgta gagcaagtct tgtgttaaaa aaagcccagt 301 gtgacagtgt catgatgtag tagtgtctta ctggtttttt aataaatcct tttgtataaa 361 aatgtattgg ctcttttatc atcagaatag gaggaagtga aatactacaa atgtttgtct 421 tggattcaag tcactagaag cataaatttg aggggataaa aacaacggta aactttgtct 481 gaaagagggc atggttaaaa atgtagtgaa ttttaaatgt ttttagcaaa atttgatttt 541 gcccaagaat ccctgtctga attggaaatg acttaatgta gtcaatgtgc ttgttggttg 601 tcttaatatt acttctgtag ccattaagtt ttatgagtaa cttcccaaat acccacgttt 661 ttctttatat gtattgtgct ttttaaaaac aaatctggaa aaatgggcaa gaacatttgc 721 agacaattgt ttttaagctt ccattaaata aaaaaaatgt ggacttaagg aaatctatta 781 atttaaatag aactgcagct agtttagaga gtattttttt cttaaagctt tggtgtaatt 841 agggaagatt ttaaaaaatg catagtgttt atttgtatgt gtgctctttt tttaagtcaa 901 tttttggggg gttggtctgt taactgagtc taggatttaa aggtaagatg ttcctagaaa 961 tcttgtcatc ccaaaggggc gggcgctaag gtgaaacttc agggttcagt cagggtcact 1021 gctttatgtg tgaaatcact caaattggta agtctcttat gttagcattc aggacattga 1081 tttcaacttg gatggacaat ttatagttac tactgaattg tgtgttaatg tgttcagtcc 1141 tggtaagttt tcagtttgat cagttagttg gaagcagact tgaagagctg ttagtcacgt 1201 gagccatggg tgcagtcgat ctgtggtcag atgcctgagt ctgtgatagt gaattgtgtc 1261 taaagacatt ttaatgataa aagtcagtgc tgtaaagttg aaagttcatg agagacatac 1321 aatgagggct gcagcccatt tttaaaaaca ttataataca aaagtatgca catttgttta 1381 catatccctg cctttgtatt acagtggcag gtttgtgtac ttaaactggg aaagcctcag 1441 atctatgatt acctggccta tcatagaaag tgtctaaata aatcactctg tcaattgaat 1501 acattagtat tagctagcat acttcattat gcctgttttc cataaatacc acaccaaaaa 1561 cttgcttggg gcagtttgag cctagttcat gagctgctat cagattggtc ttgatcctat 1621 ataataggcc aaatgtctgt aaacagctgt gctggtggaa tgtagaaagt cactgcactc 1681 agattcaact tcctgattgg aagtcatcac agtgtgatta aacattttca caaagaatag 1741 tagataaata acttggtttt taatgttaac tttgtttcca ttaagtcaca tttaaaaact 1801 tatcctcacg cctacctgag ttaattatct gttgacctag atatctttct ggccactcac 1861 tgacttattt cttgaacttt tgccatttgc ataaatcttg tcagctttgt tcttgattat 1921 gcattgtcca ggctgagcta gttgtctttc caggaatccc tttgtctctg aattaggtcc 1981 tttgtttcct aaatcatcct gcttgtttgg cacaagtctt cccaggccag tgagacctcc 2041 gtgtcctctc agcaccatag gggtaggtaa ccctggttag gctggacagg ggtttgctga 2101 gggagtttgt tcatttgaat ctaggtctta catgacgtct ttcaaatagg gtttttacct 2161 tgacactaaa ctgtccagtc taagcagttc tgcaaaatgt gagggaatta tgaacttctt 2221 cctgcagtgg gtttttatgg ttttggtttg ttttttgttg ttttggttct ttgttgagcc 2281 ctggacaaaa acttccctag ttctggtttc tacaatttaa attaaaaaca gaattcatct 2341 tagaattttt caccctcttc cccaactatt ctaatcaatc ttaagtatgc ccttcatctt 2401 ttttccttcc taaggctttt actgatagtg taattccgta ctcttcaacc ctgggaaggc 2461 tgaagtggat tcttgagctc atttcaaggc tgacctgggt gttggcaaga acccagctta 2521 gaacaaacac atgcaaggcc atcttacctt acatcctgtt gcttggactt cttcctgctc 2581 aaagttttta gtggatgcta agtgatcttt gcttccactg aggagtggaa cactttagaa 2641 tgaacctcta gatagatatt tttattgtct ggtgagggtt actggagttt cccaccctgc 2701 ctgaagggtg aatctggctt acagtgttct catctcaaag ggaagaaggc agatggctgt 2761 gtccagagag agccatcaca gtttgcttca gagacactag aatgggctgg aagatctagt 2821 ggtcttaatc agacttgaaa cctggccttt cttcattacc catatgtcta ccagtacttg 2881 ggctaacact taagccatta gggcctttgt aggggtgttt tgagaccccc tccatgctaa 2941 caaatataca ggtttcttaa catttgctca taaacttgta aagcttactt tctcttaatc 3001 caccccacat ttaacaagcc ctggtactta gaatttcaga agagtaatgg caggtaggtg 3061 tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg agagagagag agagagagag 3121 agagagagag agagagagag agagagagag agagaagttt gtggaaaatc aggtaatgac 3181 agctcatcct tttagaattg tacttcagaa tagaaacatt tggtgggctg ttaggtagct 3241 ttgattactt gtgggtagac ctgctagtat tgccagtcct caagcaatga gctttctgta 3301 tcttgtttac tagatatata ctaccaggtg agtcatttcc tggggttctg ttttctttta 3361 aaatctttcc ctaaacttaa tatgtattaa aaagtctggc ttttcagtcc attctttgtg 3421 cactgggatg gcaattgctt cattatatga caattgctgt tcccaagtca gaattcagtg 3481 tgctgatttg acatcagttc gtcccgaata agttcctgtt accaggattt acattcagca 3541 cattagaaac ttgttggtgt gcttttattc ttggagcatt ttccttagac taccttccac 3601 tttgagtgct ctgtttagga tgttgaggtg ttaggattct tgacagccag aaagactgaa 3661 cccactatct gggcacagtg ttcgtgttgc tctataaatg tatgcttttt ttgatttggg 3721 gttgttttac ctacattgtc aaactagatc catgcttaac agtgataatg aaggcttttt 3781 gtttgttttg tttgtgggtc ctcccccccc ccccaagaca gggtttctct gtaggctgtc 3841 ctagaacttg ttctttttta accaaaattt ggcaaggctg aaaatggaat cctataatca 3901 atgctggcca cattaaagtt aatagttgag aagtcttgtc tgaatttcct tgggcaaaaa 3961 gattctagcc agttcaatac cctgttgtgc aaattcaatt tgctgttata atttgctctc 4021 agttatcagt tggaaggagg ttaattctaa tgtacttgga agaggcctgt agaccatcta 4081 taactgcatc agttgtacag cgttgttgcc tgggattctc tagttcacat aaactcccaa 4141 gtcttagccg tggtgatggc tacagtgtgg aagatggtga gcattctagt gagtatcgcg 4201 atgacggcag taaagagcag caggcagccg tggctgggct cactgaccgt ggctgtaagt 4261 tacggaggca gcacacactt ctgtacacac ctctcatcag ttaccggagt cattgcattg 4321 cggactaact ggctgactca agttgtcttg ctactgaagt cttgagttgg tctcatgcat 4381 ttaccctgtt gacttgagca ccttaaagtc gaaaggatgt ctggttgtgg ctttattgta 4441 aacagcctta ggtaaagagg ggagtatatc ggttaggaag gtgaaaaatg atacttccaa 4501 gttcagtggg aaaccctggg tttatccccc agcttaagaa agaatgccta acaatgtttc 4561 agaattagat tctgtggaag gtgagggtgt tagaacagtc caaatttgtt attgtagact 4621 tgcagtggga ggaattttta aatatacaga tcagtcgaca ctcattaact tcactgataa 4681 aggtggaaac ggatgtggca acacttctaa gttcatttgt atatgtttgt aatttgattg 4741 gttgtattct gttgcactct agaatttgaa ggcaaggtta cctctgcttt ttaatttttt 4801 tttttttaaa gaaagaaaaa acactgaaag aaacttcaaa agatctgtta atgctaatac 4861 ctgaatgtgg catttaacat gtcatggaaa ctgctttgaa taaatacttg agaaaaggaa 4921 tgaaataatt gccgtttttg ttgttgagtg aatgggtgtg gtttaatgag cgtaatcatt 4981 tttataaaac agctgtgaga ctgaagtgga atccttatta aatgtggaaa atggcctttg 5041 aggattacag tagagattca actaagagag taaataaagc ttgaaactaa ttcgttgtaa 5101 attgcttcta caatcattgc tctatatagc atgctattgc caatcagttt tatgtattaa 5161 gacctatcag catgtctttt ttaggttgac ctcattttaa attataagat gctctctgta 5221 ccgttttaac atttccagga tttattcttt ctaggcaaat tccactggac tgtttccatt 5281 gtagaagctt ccttatagat tcttcaaatg aagcttacag tgtgctttct tggggttttg 5341 atttgcacta aattttattt tctgaaagat cacttatgtt tataatgtag tgctttgtct 5401 taacaattaa actttccagc actcatgca |