MicroRNA and Target Gene Description:
 
miRNA Name mmu-miR-539-3p miRNA Sequence CAUACAAGGAUAAUUUCUUUUU
Target Score 51 Seed Location 352, 4717
       
NCBI Gene ID 11991 GenBank Accession NM_001077266
Gene Symbol Hnrnpd 3' UTR Length 5429
Gene Description heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D

3' UTR Sequence

    1 attattccat ttgcaactta tccccaacag gtggtgaagc agtattttcc aatttgaaga
   61 ttcatttgaa ggtggctcct gccacctgct aatagcagtt caaactaaat tttttctatc
  121 aagttcctga atggaagtat gacgttgggt ccctctgaag tttaattctg agttctcatt
  181 aaaagaattt gctttcattg ttttatttct taattgctat gcttcagtat caatttgtgt
  241 tttatgcccc ccctcccccc cagtattgta gagcaagtct tgtgttaaaa aaagcccagt
  301 gtgacagtgt catgatgtag tagtgtctta ctggtttttt aataaatcct tttgtataaa
  361 aatgtattgg ctcttttatc atcagaatag gaggaagtga aatactacaa atgtttgtct
  421 tggattcaag tcactagaag cataaatttg aggggataaa aacaacggta aactttgtct
  481 gaaagagggc atggttaaaa atgtagtgaa ttttaaatgt ttttagcaaa atttgatttt
  541 gcccaagaat ccctgtctga attggaaatg acttaatgta gtcaatgtgc ttgttggttg
  601 tcttaatatt acttctgtag ccattaagtt ttatgagtaa cttcccaaat acccacgttt
  661 ttctttatat gtattgtgct ttttaaaaac aaatctggaa aaatgggcaa gaacatttgc
  721 agacaattgt ttttaagctt ccattaaata aaaaaaatgt ggacttaagg aaatctatta
  781 atttaaatag aactgcagct agtttagaga gtattttttt cttaaagctt tggtgtaatt
  841 agggaagatt ttaaaaaatg catagtgttt atttgtatgt gtgctctttt tttaagtcaa
  901 tttttggggg gttggtctgt taactgagtc taggatttaa aggtaagatg ttcctagaaa
  961 tcttgtcatc ccaaaggggc gggcgctaag gtgaaacttc agggttcagt cagggtcact
 1021 gctttatgtg tgaaatcact caaattggta agtctcttat gttagcattc aggacattga
 1081 tttcaacttg gatggacaat ttatagttac tactgaattg tgtgttaatg tgttcagtcc
 1141 tggtaagttt tcagtttgat cagttagttg gaagcagact tgaagagctg ttagtcacgt
 1201 gagccatggg tgcagtcgat ctgtggtcag atgcctgagt ctgtgatagt gaattgtgtc
 1261 taaagacatt ttaatgataa aagtcagtgc tgtaaagttg aaagttcatg agagacatac
 1321 aatgagggct gcagcccatt tttaaaaaca ttataataca aaagtatgca catttgttta
 1381 catatccctg cctttgtatt acagtggcag gtttgtgtac ttaaactggg aaagcctcag
 1441 atctatgatt acctggccta tcatagaaag tgtctaaata aatcactctg tcaattgaat
 1501 acattagtat tagctagcat acttcattat gcctgttttc cataaatacc acaccaaaaa
 1561 cttgcttggg gcagtttgag cctagttcat gagctgctat cagattggtc ttgatcctat
 1621 ataataggcc aaatgtctgt aaacagctgt gctggtggaa tgtagaaagt cactgcactc
 1681 agattcaact tcctgattgg aagtcatcac agtgtgatta aacattttca caaagaatag
 1741 tagataaata acttggtttt taatgttaac tttgtttcca ttaagtcaca tttaaaaact
 1801 tatcctcacg cctacctgag ttaattatct gttgacctag atatctttct ggccactcac
 1861 tgacttattt cttgaacttt tgccatttgc ataaatcttg tcagctttgt tcttgattat
 1921 gcattgtcca ggctgagcta gttgtctttc caggaatccc tttgtctctg aattaggtcc
 1981 tttgtttcct aaatcatcct gcttgtttgg cacaagtctt cccaggccag tgagacctcc
 2041 gtgtcctctc agcaccatag gggtaggtaa ccctggttag gctggacagg ggtttgctga
 2101 gggagtttgt tcatttgaat ctaggtctta catgacgtct ttcaaatagg gtttttacct
 2161 tgacactaaa ctgtccagtc taagcagttc tgcaaaatgt gagggaatta tgaacttctt
 2221 cctgcagtgg gtttttatgg ttttggtttg ttttttgttg ttttggttct ttgttgagcc
 2281 ctggacaaaa acttccctag ttctggtttc tacaatttaa attaaaaaca gaattcatct
 2341 tagaattttt caccctcttc cccaactatt ctaatcaatc ttaagtatgc ccttcatctt
 2401 ttttccttcc taaggctttt actgatagtg taattccgta ctcttcaacc ctgggaaggc
 2461 tgaagtggat tcttgagctc atttcaaggc tgacctgggt gttggcaaga acccagctta
 2521 gaacaaacac atgcaaggcc atcttacctt acatcctgtt gcttggactt cttcctgctc
 2581 aaagttttta gtggatgcta agtgatcttt gcttccactg aggagtggaa cactttagaa
 2641 tgaacctcta gatagatatt tttattgtct ggtgagggtt actggagttt cccaccctgc
 2701 ctgaagggtg aatctggctt acagtgttct catctcaaag ggaagaaggc agatggctgt
 2761 gtccagagag agccatcaca gtttgcttca gagacactag aatgggctgg aagatctagt
 2821 ggtcttaatc agacttgaaa cctggccttt cttcattacc catatgtcta ccagtacttg
 2881 ggctaacact taagccatta gggcctttgt aggggtgttt tgagaccccc tccatgctaa
 2941 caaatataca ggtttcttaa catttgctca taaacttgta aagcttactt tctcttaatc
 3001 caccccacat ttaacaagcc ctggtactta gaatttcaga agagtaatgg caggtaggtg
 3061 tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg agagagagag agagagagag
 3121 agagagagag agagagagag agagagagag agagaagttt gtggaaaatc aggtaatgac
 3181 agctcatcct tttagaattg tacttcagaa tagaaacatt tggtgggctg ttaggtagct
 3241 ttgattactt gtgggtagac ctgctagtat tgccagtcct caagcaatga gctttctgta
 3301 tcttgtttac tagatatata ctaccaggtg agtcatttcc tggggttctg ttttctttta
 3361 aaatctttcc ctaaacttaa tatgtattaa aaagtctggc ttttcagtcc attctttgtg
 3421 cactgggatg gcaattgctt cattatatga caattgctgt tcccaagtca gaattcagtg
 3481 tgctgatttg acatcagttc gtcccgaata agttcctgtt accaggattt acattcagca
 3541 cattagaaac ttgttggtgt gcttttattc ttggagcatt ttccttagac taccttccac
 3601 tttgagtgct ctgtttagga tgttgaggtg ttaggattct tgacagccag aaagactgaa
 3661 cccactatct gggcacagtg ttcgtgttgc tctataaatg tatgcttttt ttgatttggg
 3721 gttgttttac ctacattgtc aaactagatc catgcttaac agtgataatg aaggcttttt
 3781 gtttgttttg tttgtgggtc ctcccccccc ccccaagaca gggtttctct gtaggctgtc
 3841 ctagaacttg ttctttttta accaaaattt ggcaaggctg aaaatggaat cctataatca
 3901 atgctggcca cattaaagtt aatagttgag aagtcttgtc tgaatttcct tgggcaaaaa
 3961 gattctagcc agttcaatac cctgttgtgc aaattcaatt tgctgttata atttgctctc
 4021 agttatcagt tggaaggagg ttaattctaa tgtacttgga agaggcctgt agaccatcta
 4081 taactgcatc agttgtacag cgttgttgcc tgggattctc tagttcacat aaactcccaa
 4141 gtcttagccg tggtgatggc tacagtgtgg aagatggtga gcattctagt gagtatcgcg
 4201 atgacggcag taaagagcag caggcagccg tggctgggct cactgaccgt ggctgtaagt
 4261 tacggaggca gcacacactt ctgtacacac ctctcatcag ttaccggagt cattgcattg
 4321 cggactaact ggctgactca agttgtcttg ctactgaagt cttgagttgg tctcatgcat
 4381 ttaccctgtt gacttgagca ccttaaagtc gaaaggatgt ctggttgtgg ctttattgta
 4441 aacagcctta ggtaaagagg ggagtatatc ggttaggaag gtgaaaaatg atacttccaa
 4501 gttcagtggg aaaccctggg tttatccccc agcttaagaa agaatgccta acaatgtttc
 4561 agaattagat tctgtggaag gtgagggtgt tagaacagtc caaatttgtt attgtagact
 4621 tgcagtggga ggaattttta aatatacaga tcagtcgaca ctcattaact tcactgataa
 4681 aggtggaaac ggatgtggca acacttctaa gttcatttgt atatgtttgt aatttgattg
 4741 gttgtattct gttgcactct agaatttgaa ggcaaggtta cctctgcttt ttaatttttt
 4801 tttttttaaa gaaagaaaaa acactgaaag aaacttcaaa agatctgtta atgctaatac
 4861 ctgaatgtgg catttaacat gtcatggaaa ctgctttgaa taaatacttg agaaaaggaa
 4921 tgaaataatt gccgtttttg ttgttgagtg aatgggtgtg gtttaatgag cgtaatcatt
 4981 tttataaaac agctgtgaga ctgaagtgga atccttatta aatgtggaaa atggcctttg
 5041 aggattacag tagagattca actaagagag taaataaagc ttgaaactaa ttcgttgtaa
 5101 attgcttcta caatcattgc tctatatagc atgctattgc caatcagttt tatgtattaa
 5161 gacctatcag catgtctttt ttaggttgac ctcattttaa attataagat gctctctgta
 5221 ccgttttaac atttccagga tttattcttt ctaggcaaat tccactggac tgtttccatt
 5281 gtagaagctt ccttatagat tcttcaaatg aagcttacag tgtgctttct tggggttttg
 5341 atttgcacta aattttattt tctgaaagat cacttatgtt tataatgtag tgctttgtct
 5401 taacaattaa actttccagc actcatgca