MicroRNA and Target Gene Description:
 
miRNA Name mmu-miR-539-3p miRNA Sequence CAUACAAGGAUAAUUUCUUUUU
Target Score 88 Seed Location 1100, 1152
       
NCBI Gene ID 72568 GenBank Accession NM_001103182
Gene Symbol Lin9 3' UTR Length 1332
Gene Description lin-9 homolog (C. elegans)

3' UTR Sequence

    1 gcacaggatt ctggtaccca gctgcacaca gccatggtct gaggagtcct ggtccttaac
   61 ccatgcttcc aacaccagat aacctagctg ctggaaaacc ggagaactgt acatctccag
  121 atacggcttt ttaatacact ctactgcttc ttcaaccagc attgtgctga ccagcattta
  181 tttattgttc ttttattatc cagatgcagt agtgttgctt atatttcctg tttatcagca
  241 aacattttta accggaaact ctctgaacgt actatcccat ggaggataaa ccactgtttt
  301 atgcatgcat gaattctgct cagcacatgc agacgactcc tgtgacagac agagaacatg
  361 aagaagcacg gtctttccat gcatgatggt gggaatccca tccgagagtc accggtccag
  421 tggagttagt tggcattata tcttgggctg caaaatagac gtcatgagtg tgagagtccg
  481 agtcgtaagg aacccgctgg ggtacagatg ggaaacacgg acttaagtgt atgtttcata
  541 tactgacagt gggacatggt tctatagatc aattataata ataaatattt taatttatca
  601 taatttataa aagctttgtt gtttatcagc agaggaaatg aaggagccgg aggaactgta
  661 ctgtgccccg ctggatccca gcgggtggac ttggcatgcc ttccatgatt cagggcaaaa
  721 gtgttaagtg ttgagactta ttttaaaaaa gactgatgac acactatttt cgtatttttt
  781 tgtttatttg cacaacttta aaccagatga ctggttaaaa ttgaacagta cacaatttat
  841 aaagtgaaaa tcttttataa ggaaagcata tgacatgtga atacacaggg aggtttggct
  901 ttggttgttt tgtttggttt tgttttttct ttttaagaaa aaccctgcct aaaataatct
  961 tgtaaaaagt atgtatttta aaatttttgt tttaatatag aatattataa agccaaaata
 1021 taattgtttt cagatttgga gtttaaaata gagctataga ggtggttctg attctttgac
 1081 gtctcataaa atgagacttt tgtatattaa tgtataataa aactgaaata agattatttt
 1141 ccttgaaatt tttgtatagt ttaaaaatgc ttctgtgttc tttgttggta ttgggccact
 1201 gcagatctta gtgcagagtt tatatttagc tagactgtta tgttaattaa gaaatgcata
 1261 aatcttttat tcttaatatt tgtaattcta aataaatcaa tctatgaaat ttaaaaaaaa
 1321 aaaaaaaaaa aa