|
MicroRNA and Target Gene Description: |
|||
miRNA Name | mmu-miR-187-5p | miRNA Sequence | AGGCUACAACACAGGACCCGGG |
Previous Name | mmu-miR-187* | ||
Target Score | 52 | Seed Location | 2118 |
NCBI Gene ID | 56403 | GenBank Accession | NM_001284328 |
Gene Symbol | Syncrip | 3' UTR Length | 4890 |
Gene Description | synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein | ||
3' UTR Sequence |
|||
1 agactgactt gctattgtgg gattacacca gaagcttgca gtggagtaat ggtaaggaaa 61 atcaagcaac cttaaatatc tcggatgtat aggagcatat tctattgcag aagaccctcc 121 tatgaagatc atggaatcaa atacgggaca ttgaactaat acttggactt tgttatgaat 181 ttctttaaca attttctctg cagtgcaagt tattaaacta aagctactct attttccaaa 241 tgtgttccaa aaaaatcctt cataacttct agcatggtat cttaataaag aataaagttg 301 ttctctttaa aaaatctgct ctaagtagat ttttcccctc ttttttaatt aaggatctca 361 gcagtggtat tctgaaatat tctcttgaat ttgtgcattt aaattttatt gcagtgatac 421 agatgccact gttggtaccc ttaaattttt atttctgctc accaaggtta atcatgattg 481 tctatatctt ttttatagta atcacttttg aattgtgttc agatgcagtt tcaggtgtaa 541 tcatcagagc tggttagtca ggcattccag atagtggttc ttttcagaac cttttttaaa 601 gggttggtta actacctcag tagcagagga ttgaactata ccctgtctgt actgtacata 661 gaaaatcttt gtagataaaa gcaaggcttg ttaaatatga tatgagggta agattttaat 721 ataccaaatg taacattctt agttgccttt agtttcagag gcttgtaaga cttcctcatg 781 accatcataa caggccttgc ttttgtcgta ttttgtggct gaaaaagcag ccttgcttct 841 tcagatattg tagttatttg gatgtataat agtttagcaa gatgttactt ttgtaagaca 901 tcagatgttc aaaaaaaaag tgcatccgaa cttgtactaa atactgcagt gtccctttat 961 aaaaagtcag actaaaactg acaattgtac agcaaagcct gacatttgga tattttgaag 1021 ttttttcata aatcatagaa attagtatat ggctgtagtt tagcttttta ggtaaaaggt 1081 atgtttcatt agtgcatttg ttattgctga tcactataaa aatgtgaatc agctttccat 1141 ttcttatgca ggtcatgata acttgtagaa tagagtacaa tcatttgtgc tatgttttta 1201 attttctaaa gcaccttgat gacagtgagt gttcagtggt gaagcatcct ctattgaatc 1261 accctcaaaa aatttttttg ccaagtccta agttgatagc ttaaagtcaa aagtaaaatt 1321 atagtttaag taggacttgg tgtaaagaaa caccctcccc cttccccaaa gggatactgc 1381 agttctatca cacacccagt aggcaccacg atgacgatca gagctagacc tgactaaggt 1441 tttatacaca ccagttcccc agtaaatgca aatttaacaa gaaaattaga catgtcatat 1501 gttcaaaatg ctcatggcaa acaatcattt tgcattcctg caaataaaat tgttttatac 1561 tgtaagctgg aggcgagtgt aacttatttt tgtaataaag tttttatttt ttttatgtgt 1621 cattaatata aatgtgtgtt agtatagaaa atcttctggt ttaaaaactt agaattgcac 1681 acatttcagt atgttcattt gtacttacat aattttagaa tagtggttgc caatagcctg 1741 tatgtttccc attaattgtt tttttttttt cctttctttt tttttgttac cttaataaac 1801 cattttagta tgttgtatgt cagttactgg tatagctggg gcatagagtg taatttaaaa 1861 tttgtcaata agtattcatt ggaatatatg taaatgtgcc ttgccggtta ctgaaactta 1921 cctacaaaat gagtatgggg tgacaaattt gttcctggtg cttaatgaaa ctttcttcca 1981 ctgattttat atattaccct gtgcttttta aaagtacatc tctcaaatat tagtgtaagt 2041 ttgagggcta cacaaaacat gtacatttca ttctaacata ctgagtatac taggtcgtgg 2101 aaagtgggtc agttaattgt agccttcagc aaaatcaaat ctcagtgtaa tccttggtgc 2161 tggcacttcc catgtccaag gagtaaaatg atcctattta agaggtcatt gccatgccta 2221 ttggcactta actgtcatac catttttaac ggacactgtc aaggtctttt agttaattcc 2281 tggttttatt tgttgggata tttgaacagg tttgttaaac ctaactgcat tgtcaaagaa 2341 agacgaacac ttttgtgagt ccacaaatgt gttctttaag aaaacattaa agtttggagc 2401 tctttgggtt tcaaagactt ggctttttta atttggggac gtgggatgaa accttatgat 2461 tcaaaggaaa ttgtgaagaa ttgatggtta tatttaaggg taatgtaaac agtgataatg 2521 aaatgtagac tcaagtgaaa atacttgaca gtgttcattt taatgacttt gaatttaagc 2581 cattataatt acttttaaaa ttaaatataa tttgcactgt tctgataatg ggtgcagttt 2641 ttgagcaata taatcagagc taaatatgca tgtagtgatt agtgatgtga acaattaagt 2701 tctgagaaga aatactaacc gtggtatttt aaaacttaaa tttctgtaga aaaatcagta 2761 tcaaacactt accagaagtc aagaaaaaca ggcaatgcat ataaacataa ttttgaatgt 2821 tgtgtggcct ataaagcaat aatgcaattt atatggaatg tcatggatat gagaaatgga 2881 aatgcgaaaa taactaatcc tttagtaaaa atgtcaacat gttaaaaggg gggatgttaa 2941 ctaatgtagg ttattgcgtt tgtgatttgt ttatgggttc ttggctttga cagcttcaaa 3001 taatggacag atgagaagtt aaattttgta tatattgtca aggaaaggat ctttaatagt 3061 caagtccctt ccttgtggtt aaaaaatatt aatgaattct gattgttaaa aaagttacct 3121 aaccaaaaca gacgcaaggt tttgtttctg cagactactt ggcaatcaaa agtgttcata 3181 aatttagttt atcagttctc aggaaaatta ttatgagaaa attgtgttaa ttatattctt 3241 gctcagcatg tttatttttg aaagatactt agtcactgaa attgaatcac atgttaaaaa 3301 tggagaactg aattgcacaa aaggaatcac atactcacaa tggcatttaa caccatgaga 3361 aactttttac tgattattgt taaactttta ctgattgatg catatctgac aaagtatata 3421 cattttctca tgatagatta ggaataccac aaatggattg atggggcgat atgtgctata 3481 taattgtata taagatattt gaaaagatgt atttagtatt agaatgaaca acaaactaca 3541 tgggaaaatt atctttagta cacttttttg aaatttttgg tcagaaacac caaaaacata 3601 ctgttttgat gtcattattt gatggggaga aattaaaata tagaagggct tcatgcatta 3661 ggaaaaggta gtcctagagt aaatggttgc tcaggttcct aaaaattcca ataataccct 3721 ccgtgactgt tttctcccca catataaata caataaacag gaattcagtg gtgggtatca 3781 agttaatgaa taaacaactt actttaagaa tacactaaca gacttcttgg gatgttttta 3841 tggtgtagta tttactagta atcttaccac tcagtagggc atgccactaa agatgccatt 3901 tatgaaccat ggctcacaca ggcattttta aaaaactgag ccaatatata gatggacttt 3961 tggggtctgt cactttttaa aagttcttaa gacataaacc atattagcac cacagtctgc 4021 cttcaataat gtacctggaa tgtttttcag gaccagaagc attcagttgg acaaactttt 4081 ttaaatgcaa atcagtatta ctctgggtca aagatttaag tttttaacag tagtctggta 4141 aacatttaga agtctgacaa tgagaaacaa aagcttgtac ccaagtagaa tttaattaaa 4201 ttagttttta gcttatgtaa attcttttac atttatttat ccatagaatt tatatttatt 4261 tcgttccttt tgtctcactg aaagctgtct gcaggctctt tgatttggat tagatgtgtg 4321 aagtactgtc tttcgccaaa aacctcaaat ttcctgtttt tttcccaaag tagtgggttt 4381 gtgcttgttt ggagatcagt tcaaaaacta tctgtactat ctgtactgcc tctgatgtta 4441 agattttatg tatagcataa ggaagctagc tctgactata ttttcctaag aataaagacc 4501 tatttttgta gcatgtctta ggatctccag gagtccaaga attattgtga gtgtcctcca 4561 tttcatcatt tttcactcaa cagcttttaa atagacactt ggaatcttta gagctctatc 4621 atcgcctttt gatcatgcat acattcagag taattagcaa atggtgaaaa cattttctga 4681 caaaaattcc aagccacatg actggaagat gtatagaata aatgttttgg gctggtcttc 4741 atttaatttt gttttggaaa tacatggtca catatttgct aatagattta tgaactccat 4801 gataatttgc ttccttggga acatgcttca ccgtgtagta ttctattttc cagttttatt 4861 tctggcaaat aaaatttctt caaagatttg |