|
MicroRNA and Target Gene Description: |
|||
miRNA Name | hsa-miR-548j-3p | miRNA Sequence | CAAAAACUGCAUUACUUUUGC |
Target Score | 81 | Seed Location | 537, 2535, 3246, 4044, 4383, 4430, 5354 |
NCBI Gene ID | 9218 | GenBank Accession | NM_003574 |
Gene Symbol | VAPA | 3' UTR Length | 5810 |
Gene Description | VAMP associated protein A | ||
3' UTR Sequence |
|||
1 agtgaagcat gcagagtgct gtttcttttt ttttttttct cttgaccaga aaaagatttg 61 tttacctacc atttcattgg tagtatggcc cacggtgacc atttttttgt gtgtacagcg 121 tcatataggc tttgccttta atgatctctt acggttagaa aacacaataa aaacaaactg 181 ttcggctact ggacaggttg tatattacca gatcatcact agcagatgtc agttgcacat 241 tgagtccttt atgaaattca taaataaaga attgttcttt ctttgtggtt ttaataagag 301 ttcaagaatt gttcagagtc ttgtaaatgt tattttaata atccctttaa attttatctg 361 ttgctgttac ctcttgaaat atgatttatt tagattgcta atcccactca ttcaggaaat 421 gccaagaggt attccttggg gaaatggtgc ctcttacagt gtaaattttt cctcctttac 481 ctttgctaat atcatggcag aatttttctt atcccttgtg aggcagttgt tgactgagtt 541 tttcatcctt acaatcctgt cccatggtat ttaacataaa aaaaaataaa actgttaaca 601 gattcttgct cgatagcttg tttgtgtctg tcgtgttatt agagggaact ccactatata 661 tggtcacttg aaattatgat gcaaaggttt ctcttgcatt gaaaccctct tggatattac 721 agtattttta attgaaagtc ctaattctgt taaggaaagg agttgattaa attttaaggt 781 accactggta ttttgggaga ttataatcag tttgttttca agataataga aaataaggtc 841 catgagaata gaagttatgt gatttcagtg agttgatgtg tacagcatgg ctgtgctcca 901 tctgatttac cccattctta agttctgaga gtatgttctc aaggaagatt taactctctt 961 tggttttaaa ttacttttta accagcctaa taaataagtc ttactacttt tcataatatt 1021 tcataatagt taaaagtagg tgtttttttc gtgctcaatt tggcactcaa aataatgttc 1081 attatggaag tttggtaata ctgagcaagc ctgtggaatt ttctttatga aaaatgattt 1141 tagcctttgc aaatgttaac catgtgaaac acattttcag tataagtatg cgttacaggg 1201 tttgatactt tcctgcactt aggtttgtcc tattcttcat ttattcatac taggatagaa 1261 aattttggaa tcagaaaata gatccagtgt ttagctacat acaatctagt acaagtgaat 1321 ttttattctt aaacataggt gtgttggctc tttttttaaa agatgcgctc tacctgaaaa 1381 ggaaattgga ttttagaact ggatgtggtg cagtgaagta ttttaggccc aggtctgtgt 1441 acacatttta tagaagaatg aagtactctg aagtattttg gttgcctttt catttcaact 1501 gtgttttgaa tttgtcagat cacacatata ttgtgttatt gggcgctgtg gtatctttta 1561 taaaacctct tgcttgtgtg caaaagttcc taaaaggaaa cacaagtaat gcctatccat 1621 tactagcatg ctatgctgca tgctttactg ccattgctgt atgctttact gtctttgtaa 1681 aaatccccct ctcccctttt ctggtaactg gaaaagcatg ctaaaaatag tcttatattt 1741 tcaccccata aatgcagaat cagtaattcc ttggcttaaa gctcttatat aatcaatatt 1801 attggtggta aataccaagt ttggtatctc atagctatct ttttttaaag aaattaagtt 1861 cttgaaaatt tagccaaatc ccgttttatg ggaatgctct ttagaattca ttttgttcag 1921 cccctttgtt ctatggttga gaaatctgag gccttacgaa ggttaagaga actttccccg 1981 tgtctcacag gtaggtagag gcagagctgg aactagatat ctggtctgtt gactctagct 2041 cagtgtcttc tggtaactgt tgaaaattgt cttagtttga gagatggctg aaataatgaa 2101 cataaaatgc tatttataat aacaagtata tgtgaaattt cttattgtaa gactactacc 2161 ggcttactgt tgaatagttt ggttatagtg tttaggctag aaatgcctcc cacattggta 2221 ataaacatta caaaatacaa tgtattttta ggtaggcatt ttataaaatg cattatgcca 2281 tggttgcttt tgagatagat tgtagtctgg gtagcatctt taaaatgtat gtgggcttaa 2341 ctgttgttca tatcaggaga tgctctgatt gtataggtga gactctgttt ctgttatttt 2401 taattgctgt atgaaatgtg atcagattat tttactacca acagttatag tttgaaagtc 2461 caactgtatt aattgactga taatatgata atatagagat taaattgttt gtcttcattc 2521 cttatatgtt tagaagtttt tgctttgtct gcctgcttac ttgtatatgt aagcatgagg 2581 gaaatacact gttgctaata ctgaaattac aatcaagtaa ctaaggcctt gagttcatat 2641 gtgacactga atgcactagc ttccttcgtt ctataactaa tgtaccttaa cttcccccat 2701 tcttatattt acaagaagct aagtcattat gttctgagtg tgtggtatgt tcccttaaaa 2761 aaaaatgaca cttggaagaa aaatgtatga aattcagaaa ttccgatcaa agaaaagtaa 2821 ttctttcttt ttttttttga gacagagtct tgctttgttg cccaggctgg agggcagtgg 2881 tgtgatctca cctcactgca gcttccgcct cctgggttca agtgattctc atggctcagc 2941 cgcctgagta gctgggatta caggtgtgag ccaacaagcc cggctaattt ttgtattttt 3001 agtagagaca aggtttcacc atgttggtca ggctgggctc aaactcctga atccgcctgc 3061 ctcggcctcc caaagtgctg ggattacagg tgtgagctgc cgcacccagc caagaaaaat 3121 aatactctta aatacttaga tgttcaccta aagttgatat tatttggtat gggaattact 3181 tttgaactgt aatctttcag attacaccac tttgaaaaca agttttaaca gtagggtaaa 3241 aatatagttt ttgagggtat tcccaacttg tgatcttcta ccactttaga gacattcaag 3301 taatagtttt cttagagctt tgcacattcc tattcactga gattttaaaa atttcacctt 3361 tattcgaggg aaggatcaat gcttattacc atttggaaaa acgaagatca gaaggtaaat 3421 gatctttatt ttctagcttt aaagggaaat taaaccattc atgaataaac tttaaaaatg 3481 tgaagtgtcc ttttcctttt cacaatacaa aaaaaatttc aacagattgt gtggtttgtg 3541 catttatatc ctgttaagca ttaatagcta atcactggga cttgaattct gatggcagat 3601 agtctcttgc ttagtgagat ggagttaact attttttagt aggaagtgag aacagctgat 3661 tttcatgcca cgtttcatag ccccactttt ggtagactac caccacgctt cttcgcgtaa 3721 gcagtggcat cttgggaatg aatgcccagc cgctcgtggg ttggtgcaaa gaagtataaa 3781 catatatcac taaggaaaaa gaaagtttgt cttgcccttc tgacacagtg tgtgcacttc 3841 aggcaatttt tggaaaatat aaaaaattcc aaattctgcc tttcagcagc atcaattgct 3901 aggaacattt cattcatttc cctgtaatat taatgttctt taagcataat cactaattat 3961 aagttgtatc ctattttttt ccagcttaat ttctgtggtt tattgaaaac caagtataaa 4021 tgtgactaaa agcattttgc tttgttttta tagttaactt tcttaaggtt atggacattt 4081 tataatgtaa catttgattg gcctggcctc ttgacaattc ccttctagtt atgcatatcc 4141 tcctgttgcc acatttcttg ttttaaaact cagtttcttg ttttccagtt gttgctatgt 4201 ataacaccca tcttgaaaga gagtatatag gaagttattc agataacttt tgtagtagtg 4261 atattcaact atagcagtac cttaactcat gatgagctta ggaacataaa agataattgt 4321 tgcttgaata gcacccccag agatactgac ctaattggtc tggggtggag atctggcatg 4381 gtagtttttt tcaagctcca atcatcggcc agacagttgc tttatgtagg tttttaaatg 4441 ccaaaggcag atatgaagta gatttaatta agacttgact tcagcaatac aggggaactt 4501 aaaatactta tttttcttta aactgcagga gtcactgtta ggtattgctt aaaaaaaatt 4561 gcataaaagc tttgcttgtc aagttaggat tgctggaata ccactaaaga tttttgactt 4621 gtgaataaat gagctgtcat cgcaaaaagg cgatttgaga aatgtgggct tcagtattaa 4681 ttgccatttt gctgacaccc agtgtaccta cctacctgag aaatttattt tgtccatcat 4741 gtatttctca aagcaaaagg tggttttcaa gtataatgtc gttttcaaca tgcttattac 4801 ttagttttac gtcagctcat ttcatcatca ttgataactt gtgaaatact tatctccatc 4861 ctatggaata ggggagacgg gtttagacag gttcaattag ctcaagtcta cacagctgaa 4921 gtagcagaga aagtgggatc tagatggtct gatcctagtg atctaccata tgaaggacat 4981 agtttgtgtc ctggtccaag tcaaatattg actcctcaca aacagtaagt atggcaattt 5041 tgtgatgcct ttgattccac tttacatgga gtactattat ttgtgaaatg tctttaagat 5101 ttttggtctt aaatttttga agactgcttt ccccctttat ctcccagaaa attgagaaga 5161 agtaaactcc tgcccactaa caatctcagt ccgtgaacaa aaccaacatg aacattccta 5221 aacaagagtg tgtgttactc taagaagaag gctatagaat ttatggaaat ggcttatgta 5281 acctacaaga ctggagaaca gaatgtgact ggccttttct aatggtcctt taagatttaa 5341 tgattaaagc aagagttttt tataattgac tttgtggtct aaattcttga tactgtttat 5401 aattctacaa agaacaaaaa ttgttatgta ctataggcac ttaagaaccc tgaggaaaaa 5461 taatacaatg tgtgtgtgtg agagagagag tgagttactg acattgttcc aaaaaaaaaa 5521 aaaaaaaaaa aaaaaatgtg gagggttgaa atggtaagga attggaatct tttgtatttt 5581 cgagcaataa gaattcctat tcttgtttca aatagaggtt tgttaggaat tacagttgtg 5641 gggagcaaac tttctttttt gtgctgtttt aattcaaaat gtatatcctt aattgtatat 5701 aatatgtaga taaatatatg agggtattaa gctactttga attaaattta aggatatatt 5761 tcacatgaaa acaaatacaa acgagaatca aaataaagtt ttgcaaagta |