|
MicroRNA and Target Gene Description: |
|||
miRNA Name | hsa-miR-548j-3p | miRNA Sequence | CAAAAACUGCAUUACUUUUGC |
Target Score | 73 | Seed Location | 1293, 3704, 7137, 8535 |
NCBI Gene ID | 375743 | GenBank Accession | NM_001099666 |
Gene Symbol | PTAR1 | 3' UTR Length | 8826 |
Gene Description | protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 | ||
3' UTR Sequence |
|||
1 aagaggtgaa ttagtcctac aaggttcccc ttttagtgca atattgcttt cttttattat 61 ttacatagtt gcatgaactg tttactatta ttggctaacc atatgttctt cgtctttagg 121 ttgaaagtcc atagtaaatc tttcatttta tttattttgt taataactgg cattcctgtg 181 gggataaaat aatcgtatag ttccttcctg ctgaacagcg agtcttaaat tttctgttta 241 acttctcacc ctttgtattt ctatatgtgg ggcttctcat ttggttttcc tgattggttc 301 acacacacac acctctaccc ccctcagtcc aattgctgca taggcaaatt cttttaaaaa 361 ttaaaaattt aaggcctagg caggaggatt gcctgagccc aggactttga gaccaacctg 421 ggccacatag caagacccga tttctacaaa aagtaaaaca aaatagctag gcatggtgct 481 atgcaactgt gttcctagct atgcaggaag ctgaggcaga aggattgctt gagccccagg 541 tgtttgtggc tgtagtgagc catgattgca ccactgtact cagcctgggc aatagagttg 601 agaccctgtc tctaaaacaa attgaaaata aacatttatg ttgcagttca actgaagaat 661 gttggtatga atgccgaata acttgatgta attgttttga gaatcaaatg gctagatggg 721 cgaatgttta aaaatgtaaa ctagttctct ttctctagca tgttctaccc aattaccaaa 781 gtcagaagta ttggaattta tatgaaaaaa atgcttccaa tgtaatccat tttttaaatg 841 gttatttaag aaaaaactaa cttaagagtt tatgtaattg cagtaaagga aaattatttt 901 tattgctagt tttgatagat tatttttacc tcaaatttgg tatatgccaa aacacatcag 961 tccttataaa attgattttt ttttcctgaa aacctggaat gccattttta gctattacta 1021 ctttttaatt tcaaattcac ttatgacaaa tgggagaaat atataaagaa atagatccat 1081 aaaaatattc ctttttaaaa atctaaatta ttgaggatac actatggaaa ctataaaatt 1141 atcatgaagt gactgttaaa gtttactggc aaatgccaag ggaaggaata gtatgtgcaa 1201 aacaaaacac tttgatactg aacttaatca gggatgaggt accaaagtat ccacattata 1261 gccgtatctt atgtttccaa taacaagggc tgagtttttc aggtaggtgg gatgagggtg 1321 gggaatgggc catgtaatgt ctgctttctt atatttgccc ttttgtaagt ggtctgtttc 1381 ttcttttcat atactttgtt ttgccaatcc attacgtatt ttttgtcact tttgtgtgtc 1441 atttttgtat acctttcctt tcttacttca ggggtgtgtc ttcaagattt ctacccccta 1501 tttgcaatga atttcatacc tcatctaaaa tacattcata taccagaaat atgaagagtg 1561 gcccttctaa aagtttccct aatgatggaa gctgtcagtt gtcctatctg tgcagaatgt 1621 gagtaatagt ggcagaaata agtgtgacaa caatgctttg cctgttgttc tttttacttg 1681 ctaggtaatt tgtaaagtgg ggataaagat gtagggaaag taaacctctc tctcactgtt 1741 acggaaagcc tggacttgag ttaggtagac tgccttaaag aagaagaaat atgtcctttt 1801 ctttggcatc atggttttgt tgagtggcag actgttgaag tgagttgaga cttaagaacg 1861 ccagaaaagt tgtctagcct ggccccagta gacagaattt gttcttctct caagtaaaaa 1921 attacctttt tatagctttt atattattta gatgaaaaaa taccattatg aacataattc 1981 catggccctt tgtgtacaaa gcatattttg aattaaatac ctcaaggtcc acctagacct 2041 ctatggataa aatcataagt ttatgatttt tagctcctgt gagtgtttgg gggcaaacta 2101 cacagagaag acatgggtgg ttcagcccat tccactaaaa tatgttgcca gattctggcc 2161 taactcagta ttaccttttt tcctaaaaat catttttcac attttgagta atagggctta 2221 tgctttgatg tgaaaaaatg tcaggaaatg agtgtagaca ataccctata aaacactagc 2281 taagttttat agtgctccat gcctttgtgt accttccact gattatcttg cctatctttg 2341 gtgtgtaaac tattttcata tcttctaagg ctcttaaccc actcttttct gaagccgcac 2401 agtcctttaa tatgtcttgt ttccttccta aaagtttaaa gtagagagca aaaatgcaaa 2461 tacccaaagg atactgttag tatgtaactt ttgtgtgctg ctttatttct agagtttgca 2521 ttttttaatt gttcattcac agaaaatcct aatattgccc tatatggttg gtttttttcc 2581 taagtggtta atatttaaac ccgctagctg tagcatgata atgtctttga ctgagcttat 2641 gtagtagaaa ggatgtgtct gttttctggg acttttagtc ttcacttatt tttctataac 2701 aatctaattg ttaaaaggaa aagatggctt attgacacat atttcattaa actttcactg 2761 gaagaacagt gggtcatcct actgtggatt aagaatacta ctgacaagca aaaagcatta 2821 agctctgtaa ctgtctccaa caccaccttc accccgcctt tagtgtacct tagtgtactt 2881 tagtgtacct attttggcag tacggtgttt tccagattct acttgtgccc tgcacattgt 2941 gaggactcat taaatattta ttaaattaat gaatgactaa caggaagaga aagattgttt 3001 gtgagtgtta agaatgagtg atgattgaga aattgatgga ttagtgcaat ggattgggaa 3061 tgaatgatgc tttctagttt cgtaatactt gggaagagct attgcatata gagtaagttg 3121 atttagactt tttttttctt catttcatta ccttgtttaa acttgttaaa tcccagccaa 3181 gaaatgcagc tctgtaattg tcaattaact gtattataat atatattaaa aatttgtaga 3241 gctaaagaac ccacttgcat taagaacacc actttctgtt catttgtgat actagaggac 3301 agatcctgca tacagagccg aaactgcttt taatcatctg aagaaattct ttgatttcag 3361 tgacttactg atctgtacct gtgcacatat cattttatgc ttctcctttt ttccccgcaa 3421 cttgaactgt gactctttca gatatttctt aaatctgtat gagtcatttt ttaagcttag 3481 ggatttgata tgtattaatg tcccctttgt cttctgtaga ttttagcatt ttattacctc 3541 ttaagaaact ctgggcccag actttcagtc atatttctta ttcctatggt acagttctca 3601 cttaaaggct taattattag tagggttaaa tatatacagg ttatctctaa aagtacttaa 3661 atttttaaat aagggcttat gtgatacaag atacggaaac aaaagttttt ggatttttat 3721 gcagtagttt gcaggaaagc aaatacatag tagatcgtat gccacttagg tatgttcagg 3781 tcatgccagt ttattcttgt tgggccacac acacatgtat gtgtgtgtaa aaggaatttt 3841 tagtattgaa gcaaacaaat tgtcagttta ataattttct cttacatagc acaagatggc 3901 agataccacc tactgtacaa caatctaata atccctacct tagttcccct gagttataga 3961 agatgctaaa gatttagttg taaagggaag taacatgatt ttttttttct aaaaagctgt 4021 tttaagctaa ctattatttt gctactggaa aattatattt taaaacttac agatatttaa 4081 agtatgctag aaaatttgaa cctgataaca actgaacctt ttgtcttgaa taaatttctc 4141 aaatagaact gtgcaaaccc tagcacttta tgtgttgctg cctccccata cctaggtatg 4201 ctctgtaata agctcccatt taatggagag atgtgtggag gcactgagaa gttaatgaag 4261 aaaaatcaac cctaagaatt ccttattgtc acatagtgtc ttttaaaaaa taactgtaga 4321 gactgtgtta attcgagtgc ctttcttact tttttgggag caagattata tttaatgttt 4381 aagaaaacag gatggaagtt ttatcaaaca gttgattgtg gcccattgtt ttatttattc 4441 ccatcgctag gcatggcccc gtagggtatt ttatccttca gtgagagact gatataagca 4501 ggcaggatgc tttgattatt ccattagtta tcattttaag caccctacca agatttagtt 4561 ctttctttct ggcaactaac gttttggggg ttggaggcat cccatttaga ggatggtgtg 4621 tgcacaaata gattagcctg aaacctgcgt ccaaagggaa acagtggcac tctgccctaa 4681 aataaaggcc agaacgttgt cctaaatgaa tcctttgcct tactttagga ccttccttcc 4741 ctctcaaatt caggcataat gtaatatagt tgaaaggggg aaaacagtac ttgctttctc 4801 tcaggtattg gaggaaaaga agtaaatgcg tagatgaaat tttaaatgta tcattttatc 4861 tgtttgtata tggagaaggg agggatagga attccatatt tcaagatagc aaatataatt 4921 tcatagaaat atatagctaa agattccaaa gtgcttttac agagaactgt tgaataatat 4981 attcctaaag ggcagcaata tgccatgttc atggtgaaga cagaaaacca atgaatcagt 5041 tgtggatctc aggtgggaga ggaaacctca ggctcccaac tttgacttct ctactctcac 5101 caggccatgt taacactgta aaaccaaact ctttgctaag aacaatacag ggcagtagtt 5161 tagtctgctg atgaaacctt gtgcttccaa gaatattagc tatatataat ttgtgctttc 5221 tggatgattc tattgtccag aaagctaacc ctgacgttac ttttattagt ctgttgttat 5281 tcctcagggt gtagaagatt tagtaaattc aggacaaatt ttatattcag tggcaaaaag 5341 aaaaggcaaa aatatgctaa atatattatt agctcttaaa ttttagtata gatcgtattt 5401 tttataaact attaccagta cagtagctag tagatattct gtgactgcct cattgtttat 5461 cttgctgctt tggtccctat ggctctagta tgaacattct cgtgtcttct gtggaaatga 5521 tttctgtgtt atagttccat ctttggtaga ggtggggatg attgtatttt gttttagttg 5581 acatcattct caacttttag aaatactgtt gaggaaaatg attaccgttg gttttcaaat 5641 tgacaactat tttgcttcca aagacttcag tttccctttg ttttatgtgt agacctcata 5701 tatgttcaac acattgcata ctgccttgca cattgtagga attcaacaag tcaagagttg 5761 ataaaagcta gaaagataaa actagcttag ctatcatatc atcattgtcc atattcttag 5821 ctttgggaaa aatataccat tttgcataaa atacataatc agtttcaaat gcataaggca 5881 aagatataca gttgcacaac attgcaagtg aaatttacaa aggattttta tttttgtgta 5941 tgctaaaagt gctcctactt aaagcagttt tctttattag accaacacct tccagcaaag 6001 ttagaaacca aacacaagtg ctcatttgcc caaattaacc agatagttat gtaaactgtt 6061 catattaagt ctttagtggt ttacaaacaa taacattctg gcttttcttc catacctttt 6121 aggaatcagc cttaatttta agtatagcag tcactttcct caaggtacta tgcagcatac 6181 tttagattgc ttatttatca ttataaggtg ataggtaata aatttgaggt ttacttgtca 6241 tataatttca tatggcagat attgattcaa ggagcattct attagaaaaa gttgataaat 6301 tatcctccct tacaaatatc atcttgcatt tggagcaggt atttttttct tattagttaa 6361 agactgggta cagttatagt agatgctcaa taaatgctta gtcagtgatt gatctaacat 6421 caaactaaca gctttcagaa aggagactgt tgacatcttt tcaccaagga gtatatttgt 6481 agagtaatat atgtgtggaa ttttgaaatt atatcatttg acatgattta tgaggcttat 6541 ttaagctgga gttagtaacg taatagaagt attatttata cagaacatag ttgaaagata 6601 ggagatgtga aagattaagt agtattttct tgtgcaaggc atattaataa atgtaattaa 6661 atgtcttaat aagcagctgg ctgaactcta gagagaactg ctgtagtctt ctgcaatcag 6721 tctctgtatt ggtatatcca gtactatcgg gtttaggttc tttttatttt tccttaaatc 6781 ttacttgttt ctagcgtctt aagagtggta atggtaaaat gtgaagttac aataaacttc 6841 tgcttgtttt ctcagaacat ctttggcatg aggaagaact ttttgtgaat gatacagtag 6901 tctcagcatc tgttaatttg tggttttcaa agcatttttg acagagttta cctaatgtaa 6961 aaagattaaa cagttttata aaacacaaat aaacattcct acctgaactg tgaggaacag 7021 agtgtatagt acaaatgtaa ttaggcattg cctcctggcg aggttcttga tgcatgactt 7081 cgatgctggc tgctgactga ggtgaccact gtcagtattg tactttggca tatgttgttt 7141 ttaggaaaat aatggaatgc attcttagat taacttactg tttttgagtt ggaaaaaata 7201 aaagatgagg tattataagt atgccaaata tttatacact acaaaagatt aaaaaaggag 7261 agggagaaaa aaaaaggcca gttatgattt taatagcgtc taattttttt ttgactcgaa 7321 ttttgtggac actagtcaat tgcataattt aacatggagg agctttcatt taaaagaagt 7381 tctcagctac tatattctgc cattaaaatt aaccatgcct gttaatttta cattgcttga 7441 agatataagt aagctgccgt caatattgtt ttaagatttt cttatagttt atgtttaaat 7501 ggaaaagtta catatataat ctatggtgca gggtcaggca ttggccatta aagataagtt 7561 tggctaacta ttttactgaa gagactaatg gtcttccctc tgttgtactg ctatgtttct 7621 tgatctgttt ttccccaatg taacagtcta cattgaagtc ctttagctct ctccatatac 7681 taattgacat ttgttaagga ttcaatattt tgtgaattct ttttaccctt aaaatgcata 7741 tctttcagag agataagaat gaattttgca ataatttata tgcagagtgt gcttatgggt 7801 ttctgggagt tcaagttagt accccagagt gcttaaaagt atgatgctaa attctaaggc 7861 taatgtaatg actgtagatt atctatgtcc acattgttca acagaaatat aatgtgaacc 7921 acaacataat ttttaatttt ctagtagcca tattaaaaaa gaaacaagca aaattaattt 7981 taataacagt ttatgtaacc cagtatatta aaaatatcat ttcaacatgt aatcaatata 8041 aaagattatt aatgaaacac cttatcttct ttttcttcca tactaagtct tagatttgag 8101 tgtattttgc actcacagca catctcaatt ctgactggcc acattttaag tgctcagtag 8161 tcacatatgg ctaagggcta ctatactgga cagtacagat tcatagagta taaaatatga 8221 ctttaacttt ggagatggtg aggtaggcct gtaattatgg tactttaaaa attcagaata 8281 tttagaaaag catctaatag aattatccac ttgttttcct tcatcttcat tttaatatgt 8341 tctagaagta ggatcagcct gttccaattt gccaagcatt attaaggagg aataattcca 8401 taccatgtaa aataccatga tatgctgatt atactacatt aacaaatttt taagttgcgt 8461 tcactaaatt ctgtcctgtt tcttcaaaat aatatagctt aaattgcatg ttaattgtat 8521 atcttaccta ttttgttttt atattattct tacaatataa tcatgtatat taacaaacag 8581 ccctgggatt ctaatcttcc tctgcaactg tcttccagga cttactggca cttattacac 8641 tgtgataagt ggcagaaaag tagaatgaaa tattcttttt ccattagatt tgttcttatg 8701 tgaccatgta ccaagccagc tataaagtat tgtatttctg tagaatatgg aaaatagtat 8761 ttgtcttacc tttgctaaat gtttgcaatt tctaagtaaa ccttttatct cctaaaatga 8821 aaaaaa |